1、证件名称不同：
不动产权证和房产证最大的区别就是名称不同，房产证全名为《中华人民共和国房屋所有权证》。不动产权证书全名为《中华人民共和国不动产权证书》。
2、内容不同：
房产证和不动产证在内容上就有很大的区别：房产证包含房屋所有权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况；而不动产权证对比房产证增加了镭射区、不动产单元号、适用期限等内容。
3、监制机关不同：
不动产权证和房产证的监制机关不同，房产证监制单位为中华人民共和国住房和城乡建设部。国务院机构改革前，为中华人民共和国建设部。不动产权证书的监制单位是中华人民共和国国土资源部。
4、权证编号不同：
房产证包括两个编号，分别是建房注册号和房屋所有权证号。不动产权证书也包括两个编号，分别是证书编号和不动产权编号。
5、版本不同：
不动产证是有两个版本的，包括单一版和集成版：单一版证书记载一个不动产单元上的不动产权利；集成版证书记载同一权利人在同一登记辖区内享有的多个不动产单元上的不动产权利。而房产证只有一版本。
主要体现在维护房地产交易安全，保护权利人的合法权益。房屋是重要的财产，属于民法上的不动产的范畴。房地产登记是公示房地产物权变动情况，保障房地产交易安全的一项基础性法律制度。
房屋的权利状况不能通过占有来进行判定，其交易风险自然高于动产，为了避免交易过程中可能出现的风险，当事人就要对房屋权利状况进行详细调查，因此，需要建立房屋登记制度来明确房屋的权利状况，这样既可以保障房屋权利人的权利得到登记机构的公示，也方便相关的利害关系人对房屋权利现状进行了解，有利于保护房地产交易的安全。
