1、含义不同：
宅基地是我国特有的土地类型，是当前农村村民合法拥有房屋和用地的权利凭证，其主要获得途径是为了能给农民申请建房的。在申请通过后会有《宅基地使用证》;房产证是在房产机关登记过的房屋产权证明，购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。
2、土地性质不同：
宅基地证是农村集体土地;而房产证是国有土地。
3、土地的获得方式不同：
宅基地的地有的是很早分的没交钱，有的是现在交钱分到的;房产证的地是通过国家公开招拍拿到的，必须交钱。土地的发证机关也不一样，宅基地的证是乡里的，房产证的地是县级以上国土局发的。
4、能否买卖：
宅基地证是不让买卖的，房产证是可以买卖的。
人人都知道城市里的房子都是有房产证的，而对于农村来说，建的合法房屋也是有房产证，因为依据国家相关规定，只有依法利用宅基地建造的村民住房，以及依法利用其它集体建设用地所建造房屋，是可以依照规定规定申请房屋登记。
由于在农村盖房子需要有《集体土地使用证》和《建设规划许可证》，所以农民是可以凭借这两个证件去房管所换取房产证，不过在过去农民都不怎么注重这个证，所以很少去领取，只是因为现在涉及到很多拆迁问题，所以大家领取的频率更高了。
